9 сентября 2003 г. Судебная коллегия по уголовным делам Верховного Суда Российской Федерации оставила приговор без изменения, кассационную жалобу – без удовлетворения. 11 августа 2005 г. в Сыктывкарским судом за нарушения режима переведен на 2 года в тюрьму, находился в учреждении ЮН 78/5 города Димитровграда Ульяновской области.
Длительное находился в колонии в поселке Нижний Чов в республике Коми, ОС- 34/1. Болен гепатитом. Освободился в апреле 2011 года, полностью отбыв срок в 8,5 лет лишения свободы.
Основания признания политзаключенным: фабрикация дела в рамках дел против чеченцев.
По версии обвинения Талхигов по сотовому телефону передавал террористам информацию о местонахождении техники и передвижении бойцов спецназа вокруг театрального центра. Телефонные разговоры Талхигова были зафиксированы спецслужбами, однако вышли на него не сразу. Как оказалось, для своих разговоров он использовал телефон голландских граждан. Для демонстрации пособничества в суде была предъявлена одна запись переговоров (перевод с чеченского), другие записи не были предъявлены и были уничтожены либо утрачены.
Согласно показаниям Талхигова и свидетелей, он явился к захваченному зданию по призыву Аслаханова, а все переговоры с единственной целью освобождения заложников вел под контролем ФСБ. Телефоны террористов он также получил от Аслаханова и ФСБ. Затем выпил стакан сока в штабе – и проснулся уже задержанным. Вину не признавал и не признает. Подвергался побоям и угрозам.
Признание лица политзаключённым не означает ни согласия ПЦ «Мемориал» со взглядами и высказываниями признаваемых политзаключёнными лиц, ни одобрения их высказываний или действий.
