20 января 2010 года Европейский суд по правам человека вынес решение по жалобе "Гисаев против России" (Gisayev v. Russia, №14811/04). Жалоба была подана в Европейский суд 19 апреля 2004 года Правозащитным центром "Мемориал" (Москва) и Европейским центром защиты прав человека (EHRAC, Лондон). На
Ахмед Гисаев, уроженец г. Грозного Чеченской Республики, был похищен 23 октября 2003 года из своего дома в Грозном российскими военными. Ахмед был доставлен в «секретную тюрьму» – незаконное место содержания, где его две недели жестоко пытали, чтобы получить информацию о чеченских боевиках. Ахмеда освободили 7 ноября 2003 года, после того, как его родственники заплатили 1 500 долларов выкупа.
Суд признал, что Ахмеда Гисаева пытали представители властей РФ. Тем самым Суд констатировал наиболее тяжкое из возможных нарушений статьи 3 (запрещение пыток) Европейской конвенции о защите прав человека и основных свобод.
Власти в очередной раз отказались предоставить Суду копии материалов уголовного дела, сославшись на секретность сведений о военных операциях, и утверждение Правительства РФ о том, что было проведено эффективное расследование, не было подкреплено никакими доказательствами. Суд установил нарушение статьи 3 в процессуальной части (факт пыток не был расследован должным образом).
Суд постановил, что заявитель не смог добиться расследования российскими властями уголовного дела, то есть была нарушена статья 13 (право на эффективное средство правовой защиты) во взаимосвязи со статьей 3 Конвенции.
Суд также признал, что Ахмеда незаконно содержали под стражей в секретном месте, а это полностью противоречит гарантиям, предоставляемым статьей 5 (право на свободу и личную неприкосновенность) Конвенции.
Европейский суд по правам человека постановил выплатить заявителю компенсацию в размере 55 000 евро за моральный ущерб и обязал российские власти выплатить представителям заявителя 1 957 евро за предоставленные услуги.
С лета 2008 года Ахмед Гисаев работал в представительстве ПЦ «Мемориал» в Грозном. Вместе с Натальей Эстемировой он занимался расследованием преступлений, совершённых сотрудниками силовых структур (например, делом о похищении Апти Зайналова (стр. 54)).
Вскоре после убийства 15 июля 2009 года Натальи Эстемировой вооружённые люди стали демонстративно следить за Ахмедом и угрожать ему. По настоянию ПЦ «Мемориал» Гисаев с женой и ребёнком выехал за пределы России.